Hermokantasolujen live analyysi käyttäen Altami Studio-ohjelmistoa
Olen akateemisen tutkimuslaboratorion dosentti Kalifornian yliopistossa. Laboratoriomme tutkee kantasolujen erilaistumista tuotamaan eri hermosolujen tyypit käyttäen Altami Studio-ohjelmistoa. Live-kuvien kaapamiseksi meidän laboratorio käyttää Olympus-käänteismikroskooppi (IX70), jotka liittyy FLIR Blackfly U3-23S6C 2.3 MP Väri USB3.0- kamera. Kameralla on Sony IMX249 anturi, joten avulla ottaa molempia valkoisia ja fluoresenssia kuvia. Valitettavasti PGR-ohjelmisto (Flycapture) ei ole sopiva mikroskopialle. Siksi meidän on etsittävä vaihtoehtoisia ohjelmistoja sekä hankintaan sekä kuvan mittauksiin, jotka ovat tärkeää työmme puolesta. Löysimme Altami Studion, jotka on kehitetty Altami Sähköisillä ratkaisuilla (Alelso). Tämä ohjelmisto oli parhaiten meidän tarpeisiin, koska se on soveltu mikroskopian käyttöön. Testasimme ohjelmisto arvioida sen soveltuvuus ja yhteensopivuus meidän mikroskoopin ja FLIR (Point Grey)-kameran kanssa.
Ensimmäinen asia, huomasimme oli, että kun asennus ohjelmisto helposti to z ed kamera, joka oli erittäin hyvä merkki siitä, että ohjelmisto on yhteensopiva tämän sarjan kamerat. Tämä teki meidän elämästä erittäin helppoa, koska ei ollut vianmääritys mukana ollenkaan. Altami Studio ei vain havaita perus kamera-asetuksia, se myös helposti tunnistaa eri-yhteensopiva tilat mukaan lukien 2X2 joutaa roskakoriin tilassa samoin kuin-Tilassa 0 ja Mode-7-kamera (ks. Kuva alla).
Hankinta ja Kalibrointi
Ohjelmisto on erittäin helppo käyttää ja meidän tutkimusryhmä löysi useita yritysostoja vaihtoehtoja olla itsestään selvä ja suoraviivainen verrattuna ohjelmisto, joka tuli kamera Point Grey Research/FLIR. Se voi kaapaata sekä still-kuvia sekä timelapse videoita tarvittaessa.
Olemme helposti voi setup eri kalibrointi tiedostoja kameran eri tavoitteita, käyttäen mikrometriä ja eri liikennemuotojen kameran kuten voidaan nähdä kuvan edellä. Käyttäen tätä voimme helposti käyttää kalibrointi yksittäisessä kuviessa hankintaessa tai sen jälkeen . Tämä oli erittäin hyödyllinen sekä mittausten välillä pistettä ja soveltaa scalebars kuvat (ks. kuva alla).
Alla on muutamia esimerkkikuvia hermokantasolujen yhdyskunnat otettu Altami Studio-ohjelmiston kautta. Laaja dynaaminen alue kamera yhdistettynä hyväksytty yhteensopivuus antaa meille mahdollisuuden kaapata selkeitä kuvia brightfield ja hyväksytty fluoresenssi kuvia solujen kulttuuri kamerasta.
Edellä kuvat on otettu käyttämällä kaikkien asetusten auto-tilaa. Nämä osoittaa, kuinka hyvin ohjelmisto voi mukauttaa eri valon tasoihin tulossa kameraan.
Ohjelmisto mahdollistaa myös käyttäjälle tallentamaan tiedostoja useissa eri muodoissa, kuten TIFF, BMP, JPEG sekä Altami oma muodossa.
Suodattimet ja Panoraama
Yksi muita ominaisuuksia, jotka on erittäin hyödyllinen mikroskopia sovelluksia on kyky soveltaa erilaisia suodattimia kuvia tarvittaessa. Ohjelmiston mukana tulee useita näistä suodattimet valmiiksi asennettu ohjelmisto. Tyypin kamerasta rippuen, voi käyttää Väri-tai Harmaa-Asteikon Muutoksia. Siellä on myös kyky luoda käyttäjän asettamia suodattimia, jotka emme testaaneet, mutta on mielenkiintoista nähdä, miten se toimii. Asteikko-bar-vaihtoehdon avullavoi muokata fontteja sekä asteikko-bar kokoa.
Lopuksi, yksi vaihtoehdoista, joka on erittäin hyödyllinen mikroskopia on kyky stich yhdessä kuvia otettu eri aloilla, jotta luoda suurempi kuva koko kentän. Tämä voidaan tehdä käyttämällä Panorama-vaihtoehtoa Työkalujan panelissa. Tämä on, jos ohjelmisto todella kunnostautuu. Alla on esimerkki yksi tällainen kuva pystyimme kaapaamaan muutaman minuutin päässä yksittäiset paneelit vasemmalla kuvan. Työkalujen vaihtoehto sisältää Multi-Focus joka sopii 3D-rakenteihin.
Johtopäätös
Meidän käyttää niin pitkälle ohjelmisto, me on hämmästynyt siitä, kuinka hyvin se on vuorovaikutuksessa meidän 3rd party kamera. Käytämme mielellämme ohjelmistoa ja se mahdollistaa mikroskopien kuvien sujuvan hankinta tutkimuslaboratorion ympäristössä. Arvostamme tämän ohjelmiston ja erittäin suosittelemme sitä tahansa käyttäjälle empimättä. Toivomme, että yhtiö edelleen kehittää ohjelmistoa ja tarjota jatkuvaa tukea.